Jailbreaking af en iPhone til trods for at annullere din garanti forhindrer dig ikke i at fortsætte med at bruge alle de apps, du har købt via iTunes App Store. Snarere tilføjer processen en alternativ appbutik, Cydia, til din telefon, som fungerer sammen med den officielle App Store. Selvom jailbreaking i sig selv ikke fjerner dine gamle apps, kan processen lejlighedsvis kræve, at du gendanner telefonens operativsystem, hvilket tvinger dig til at gendanne dine apps fra en sikkerhedskopi eller til at downloade dem igen.
Normal jailbreaking-proces
Når du kører et jailbreaking-værktøj på din computer, sender softwaren forskellige kommandoer til din telefon. Under denne proces kan din telefon muligvis genstarte flere gange. Når jailbreak er afsluttet, skal din telefon stadig have alle dine gamle apps plus Cydia-appen. Du kan downloade apps og systemtilpasninger fra Cydia, mens du fortsætter med at købe apps fra iTunes App Store.
Brug af iTunes
Selv efter jailbreak kan du fortsætte med at synkronisere med iTunes på din computer. Synkroniseringsprocessen ændrer eller fjerner ikke dine App Store-apps eller dine Cydia-apps. I nogle tilfælde kan tilpasninger fra Cydia dog medføre, at apps vises forkert på iTunes. For eksempel, hvis du skjuler apps på din telefon ved hjælp af en jailbreak-tweak, vises de stadig på iTunes på din computer. På trods af inkonsekvensen fungerer synkronisering korrekt.
Potentiel risiko
Både jailbreaking selv og installation af apps fra Cydia medfører en vis risiko for at ødelægge din telefons system. Hvis dette sker, skal du gendanne telefonen ved hjælp af iTunes. Mens du aldrig mister adgang til dine købte apps - du kan altid downloade apps, du har betalt for - denne proces sletter dine appdata og gendanner dem til datoen for din sidste synkronisering. For at undgå tab af data skal du altid synkronisere din telefon, før du jailbreaker eller tester nye jailbreak-apps.
At miste Cydia-apps
Mens jailbreaking ikke fjerner App Store-apps, opdatering af din telefons system, gendannelse eller re-jailbreaking fjerner alle apps, der er downloadet fra Cydia. Efter et nyt jailbreak skal du downloade alle sådanne apps igen. Betalte apps forbliver bundet til din Cydia-konto, så du behøver ikke betale igen. Du kan også installere Cydia-backup-apps såsom PKGBackup eller xBackup for at sikkerhedskopiere og gendanne dine Cydia-apps på én gang.