Amazon Kindle er kompatibel med flere typer elektronisk bog (e-bog) og bruger de forskellige filtyper afhængigt af omstændighederne. E-bøger købt via Amazon gør brug af virksomhedens proprietære format, som inkluderer et beskyttelsessystem til digital rettighedsadministration eller DRM. Kindle kræver dog ikke altid, at du bruger copyrightbeskyttet materiale og accepterer andre formater i en DRM-fri tilstand.
AZW
Amazon lancerede sit proprietære e-bogformat, der bruger præfikset ".AZW", samtidig med at den originale Kindle-enhed blev frigivet. Formatet bruger sin egen form for DRM-beskyttelse for at undgå tyveri af ophavsret. Det giver mulighed for alle former for tekstformatering og inkluderer mulighed for illustrationer og omslagsbilleder i e-bøgerne. Kindle-enhedens succes har drevet AZW-formatet til en dramatisk stigning i popularitet. Det understøttes nu af en række forskellige elektroniske læsesoftware og -hardware udover Kindle.
MOBI og PRC
Mobipocket-e-bogformatet er betegnet med ".MOBI" -præfikset, som kan udskiftes med ".PRC" -filtypen, der oprindeligt blev populariseret af Palm Palm Pilot-PDA-enheder. Kindles eget proprietære format er baseret på Mobipocket-standarden, men adskiller sig i dens copyrightbeskyttelsesmetode. MOBI e-bøger giver mulighed for tekstformatering, et forsidebillede og elektroniske bogmærker. Et af de længst kørende e-bogformater, MOBI er en af de mest populære og bredt understøttede typer elektroniske bøger. Kindle er ikke i stand til at bruge DRM-beskyttede MOBI-filer, selvom Amazon nu ejer Mobipocket-firmaet.
Kindle understøttede oprindeligt ikke Adobes populære PDF-dokumentfiltype. Kompatibilitet er siden blevet tilføjet gennem en softwareopdatering, selvom denne kompatibilitet er begrænset til enkle versioner af dokumenttypen åben standard. PDF-filer indeholder ofte kompleks grafik, paginering og internetfunktionalitet, som Kindle ikke kan løse, selvom de fleste tekstbaserede dokumenter kan vises med rimelig nøjagtighed. Selv den nyeste Kindle-model bærer stadig den advarsel, at PDF-understøttelse er eksperimentel, og at dokumenter muligvis ikke vises korrekt.
TXT
Almindelige tekstfiler - betegnet med ".TXT" filtypen - understøttes fuldt ud af Kindle og har fordelen ved at skabe meget små filstørrelser og næsten universel support på computere og bærbare enheder. Ulempen ved at vise e-bøger ved hjælp af TXT-formatet er manglen på tekstformateringsmuligheder og ingen understøttelse i dokumentet til kommentarer, illustrationer eller interaktive funktioner. Kindle er i stand til at tilføje sine egne bogmærker til TXT-filer, men det sikres, at filerne stadig er et brugbart og praktisk valg til e-bøger.
